兩側輸卵管不通伴積水可以通過口服藥物、微波治療、紫外線照射、輸卵管通液術、輸卵管粘連分離術等方式進行治療。
1、口服藥物：
兩側輸卵管不通伴積水通常是感染沙眼衣原體、淋病奈瑟菌、支原體等病原微生物引起的，可以在醫生的指導下口服鹽酸左氧氟沙星膠囊、甲硝唑片、替硝唑片等藥物進行治療，能夠起到消炎的作用，從而改善癥狀。
2、微波治療：
微波治療是利用微波的高頻震動，使組織內的水分子高速運動，從而產生熱效應，改善輸卵管的血液循環，促進炎癥吸收，從而改善輸卵管不通、積水等癥狀。
3、紫外線照射：
紫外線照射具有消炎、殺菌的作用，通過紫外線對局部的照射能夠使局部組織溫度升高，促進局部組織對炎癥的吸收和消退，從而使輸卵管不通、輸卵管積水等癥狀得到緩解。
4、輸卵管通液術：
是將生理鹽水自宮頸口注入宮腔，再由宮腔進入輸卵管，通過注入藥液時的壓力，能夠使輸卵管局部輕微粘連得到疏通，使積水得到清理，從而改善輸卵管不通的癥狀。
5、輸卵管粘連分離術：
此種手術方式通常包括卵巢輸卵管周圍粘連分離術和盆腔臟器粘連術，是將輸卵管周圍，特別是傘端的粘連分離，通過手術治療能夠使輸卵管得到疏通，保持自由伸展游離的狀態，恢復輸卵管的功能。
平時應養成良好的衛生習慣，勤清洗外陰部位，勤換內褲，能夠減少炎癥的發生，也可以減少患病風險。
