肛瘺這種疾病在做完手術后是有復發的可能,肛瘺的復發率約為10%,有些情況統計的數據為5%,肛瘺術后復發的原因95%以上是因為沒有準確的找到內口,或沒有把感染的原發病灶,感染的肛竇,肛門腺導管,或者是肛門腺,以及瘺管的支管的空腔,完全徹底地清除干凈,因為禍根沒有除掉,所以就會引起復發。
由于肛竇很小,肛門腺導管和肛門腺走向彎曲,有的向上,有的向下,廣泛分布在括約肌間隙之間,感染后可以四處蔓延形成彎曲,還有多個分支室腔的復雜情況,所以手術時要準確找到原發的內口,不是一件很容易的事,特別是那內口有兩個以上,位置較高的高位復雜性肛瘺,就更困難了,萬一找不到內口,或在尋找中,人為的用探針捅出了一個內口,手術后就會出現傷口不愈合,或再次出現肛瘺,不時的破潰、流膿的情況。