在以報告的伊曲康唑的不良反應中,常見的是胃腸道的不適,如厭食,惡心,腹痛和便秘,少見的副作用包括頭痛,可逆性的肝酶升高,月經紊亂,頭暈和過敏反應。有個別病例報告出現了外周神經病變。
在接受伊曲康唑膠囊長療程大約一個月以上治療時,有見低血鉀癥,水腫,肝炎和脫發等癥狀。對于持續用藥超過一個月的患者以及治療過程中,如出現厭食,惡心,嘔吐,疲勞,腹痛或者尿色加深的患者建議檢查肝功能,如果出現異常應停止用藥。伊曲康唑絕大部分在肝臟代謝,因此肝功能異常的患者要慎用,當發生神經系統癥狀時應中止治療。腎功能不全的病人,因為排泄減慢建議監測伊曲康唑的血藥濃度以確定適宜劑量。