一般情況下，主要是依據(jù)患者有感染病史或者某些藥物應用史，有特征性的臨床表現(xiàn)結合實驗室以及影像學檢查有助于診斷，但是腎臟的病理仍然是診斷間質(zhì)性腎炎的金標準。
臨床出現(xiàn)不明原因的急性腎功能不全時，要考慮急性間質(zhì)性腎炎的可能性，一般情況下具有一定特征的要考慮慢性間質(zhì)性腎炎，比如存在導致慢性間質(zhì)性腎炎的誘因，長期服用止痛劑，慢性尿路梗阻，或者有慢性間質(zhì)性腎炎的家族史，臨床表現(xiàn)有腎小管功能障礙，煩渴，多尿，夜尿增多，腎小管性酸中毒或者腎功能不全，但是沒有高血壓沒有高尿酸血癥，尿液檢查，表現(xiàn)為嚴重小管功能受損。
再就是出現(xiàn)有尿糖，尿中有氨基酸，對于間質(zhì)性腎炎，需要與急性腎小球腎炎，急進性腎小球腎炎，其他原因的急性腎衰竭相鑒別，一般情況下對于慢性間質(zhì)性腎炎，要考慮一下疾病的鑒別，鑒別困難時，可以進行穿刺病理檢查，這樣才能夠有助于診斷。
另外高血壓腎損害，在臨床上，表現(xiàn)類似慢性間質(zhì)性腎炎，但是長期有高血壓病史，往往會伴有心臟、眼底等靶器官的損害，慢性腎小球腎炎，常有顯著的蛋白尿，血尿，水腫，高血壓的改變。
