中毒型細(xì)菌性痢疾應(yīng)該與急性胃腸炎，阿米巴痢疾等鑒別，細(xì)菌性食物中毒多集體發(fā)病，起病急，病程短，嘔吐劇烈，水樣便，流行性乙型腦炎的流行季節(jié)，臨床表現(xiàn)與急性重型中毒型菌痢相似。應(yīng)及早做鹽水灌腸，采取大便標(biāo)本做鏡檢細(xì)菌培養(yǎng)，以明確診斷。
阿米巴痢疾病起病一般緩慢，少有毒血癥癥狀，里急后重感輕，便次較少，要注意與菌痢相區(qū)別，其腹痛以右側(cè)為主，典型者有果醬樣大便，糞鏡檢檢紅細(xì)胞成堆而白細(xì)胞少，可找到阿米巴滋養(yǎng)體，乙狀結(jié)腸鏡檢查所見，兩者不同與病變部位，取材檢查病原體也不相同。
致病性大腸桿菌性腸炎多發(fā)生于兩歲以下兒童，五到八個(gè)月發(fā)病率較高，糞便可有黏液，有腥臭味兒，較為稀薄，呈蛋花湯樣，大便次數(shù)較多，容易引起脫水、酸中毒，急性腸炎，常常以家庭和集體發(fā)作，嘔吐多見，大便黏液多于膿，常呈綠色膠凍狀，里急后重較為少見，糞便細(xì)菌培養(yǎng)可以確診。
病毒性腹瀉多見于兩歲之內(nèi)兒童，起病急，伴有上呼吸道感染癥狀，大便呈水樣或蛋花湯樣，可有少量黏液，無腥臭味兒，糞便細(xì)菌培養(yǎng)陰性。
阿米巴痢疾南方多見，多發(fā)于年齡較大的兒童，起病較慢，大便次數(shù)較多，但無里急后重，大便有血和黏液，呈紫紅色果醬樣，新鮮大便黏液鏡檢可以找到阿米巴滋養(yǎng)體，細(xì)菌性痢疾紅細(xì)胞少于白細(xì)胞，阿米巴痢疾反之。
