慢性再生障礙性貧血發病機制主要是由于各種病因導致了骨髓造血干細胞或者是造血祖細胞受到損壞或者是破壞了骨髓造血微環境,導致骨髓造血功能出現減低或者是衰竭,病人往往有可能會出現骨髓增生減低或者是重度的減低,可以出現外周血全血細胞減少。
另外,慢性的再生障礙性貧血發生還有可能和免疫因素有關系,有一些免疫疾病有可能會使造血組織損傷,可以損壞造血干細胞,使得造血干細胞減少或者是缺陷,從而也不能正常造血,所以可以發生慢性的再生障礙性貧血。導致慢性再生障礙性貧血的因素主要是包括藥物因素,化學毒物,電離輻射以及病毒感染等。