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安徽醫科大學口腔醫學院是培養口腔醫學高級人才的省屬重點口腔教育基地。1984年建系，同年獲準招收口腔醫學專業本科生，2000年成立口腔醫學院。目前設有口腔醫學1個本科專業，年招生本科生60人。2000年獲口腔臨床醫學碩士學位授予權，與中國科學院合肥物質科學研究院聯合招收博士學位研究生。2006年經教育部批準對港澳臺地區招收口腔碩士研究生。2008年口腔臨床醫學被遴選為省級重點學科，口腔醫學中心實驗室被批準為中央與地方高校共建項目實驗室和安徽省口腔疾病研究省級實驗室。2009年獲批口腔醫學碩士專業學位授予點。2010年獲批口腔醫學一級學科碩士學位授予權。2011年口腔醫學被遴選為省級特色專業建設點。口腔醫學專業是我省“第一批次”招生的本科專業，累計招收本科生1268人，畢業生968人，在校生300人。積極發展研究生教育，目前在學碩士研究生66人。畢業生遍布國內外大學、科研院所和各級醫療機構，承擔教學、科研和醫療工作，得到了社會各界的一致好評。
口腔醫學院現有口腔解剖生理學、口腔組織病理學、口腔內科學、口腔頜面外科學、口腔修復正畸學、口腔預防醫學等6個教研室和口腔醫學、口腔醫學美學等2個研究所。學院教師年齡、職稱和學歷層次分明，結構合理。現有教職工68人，其中專任教師54人，高級實驗師2人。專任教師隊伍中，正高職稱教師10人，占 18.5 %，副高職稱教師7人，占 13.0 %，中級職稱教師20人，占37.0 %，初級職稱教師17人，占31.5 %。博士生導師1名，碩士生導師14名。具有博士學位者10人，占18.5 %，碩士學位者37人，占68.5 %，學士學位者7人，占13 %。目前有4名教師在職攻讀博士學位。
口腔醫學院是安徽省口腔修復、正畸及修復工藝委員會掛靠單位、安徽省康復醫學會頜面創傷專業委員會主任委員單位。現有國際牙醫師學院院士3人，30人次在中華口腔醫學會及其它專業學會擔任理事(委員)以上職務。與香港大學牙醫學院、臺灣中山醫學大學、美國哥倫比亞大學、中國科學院及中國科學技術大學開展科研合作項目。年學科建設及科研經費300多萬元，承擔國家自然科學基金項目10項，省科技攻關項目4項，省、部、廳、委級科研項目50余項，出版學術專著20余部，獲國家及省部級科研獎項10多項。近5年來發表科研學術論文300余篇，其中SCI論文30余篇。
口腔醫學院同時掛安徽醫科大學附屬口腔醫院、安徽省口腔醫院牌，實行“三位一體”管理，是安徽唯一的省級口腔專科醫院。醫院科室設置齊全，擁有床位30張，牙椅70張。2008年被國家民政部和李嘉誠基金會批準為“重生行動-全國貧困家庭唇腭裂兒童手術康復計劃”項目安徽省唯一項目承辦單位。
口腔醫學院依托大學資源和優勢，經過多年發展和壯大，業已成為安徽省口腔教學、科研和醫療基地。
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