自發性食管破裂在發病早期容易被誤診，在確診后治療又很困難，非手術治療的病死率很高。早期診斷選擇正確的外科治療方案，是挽救患者生命的關鍵。外科方案的選擇選擇一般如下：
第一，食管破口修補術，適用于食管自發性穿孔發病后小于二十四小時，全身情況較好，縱膈及胸腔內感染不重，食管破口較小的患者。用代替肋間肌、胸膜瓣或膈肌瓣格修補破口，用抗生素溶液反復沖洗胸腔及縱膈。留置胸腔閉式引流管，術后嚴密觀察食管破口漏的發生，早期發現，早期處理。
第二，一期胃代食管術，適用于患者發病時間小于二十四小時，胸腔內感染不重，全身情況較好，術中發現食管破口較大，局部食管壁有嚴重充血水腫而不能修補者，術中要切除破裂食管并杜絕感染源。食管胃吻合口要遠離污染區，此術要嚴格把握適應癥，否則一旦發生吻合口瘺，患者生存可能性極小。
第三，食管切除，頸段食管外置。縫合關閉賁門口，即胃造瘺術，適用于食管自發性發現破裂超過二十四小時以上，胸內有嚴重感染的病例。病情穩定，胸內感染完全控制后再擇期行食管重建術。
第四，胸腔閉式引流及空腸造瘺術，適用于自發性穿孔超過二十四小時，全身狀況很差的患者。禁食、空腸造瘺管、維持營養、強有力的抗生素及充分引流，以爭取二期手術的機會。
第五，延期結腸代食管術，適用自發性破裂后接受過食管切除，頸段食管外置，胃造瘺術后，初診時發病超過二十四小時全身狀況差。經胸腔閉式引流及空腸營養得以存活的患者，行二期手術重建消化道的連續性。
