理解性別煩躁，一個重要的前提就是首先去理解人類正常的性別發(fā)育過程，特別是出生前的性別分化過程，正常的情況下基因會決定胎兒的性腺和激素性質(zhì)，影響了胎兒性別的這個生物表情，這個是性別分化的一個基因表型途徑，與此同時的胎兒的大腦也進行一個性別分化的發(fā)育，這個是性別分化的神經(jīng)途徑。
研究表明以下的部位和區(qū)域是大腦的一個性別分化過程中至關(guān)重要的，就是下丘腦內(nèi)側(cè)前實區(qū)，主要負責是男性性行為相對于異性戀的女性，和同性戀的男性，異性戀男性的前聯(lián)合小于下丘腦內(nèi)側(cè)全是蛆，更多的對雄激素敏感的神經(jīng)元，是另外兩種的2.5倍，上視交叉和在異性戀女性和同性戀男性當中，那么上市交叉核比異性戀男性大。
胼胝體，異性戀女性的胼胝體大于異性戀男性。前聯(lián)合，異性戀男性的前聯(lián)合小于異性戀女性和同性戀男性，從這些證據(jù)我們可以看出胎兒神經(jīng)發(fā)育過程的問題可能成為性別煩躁的一個發(fā)病基礎(chǔ)，對內(nèi)分泌的特長，我們發(fā)現(xiàn)基因正常男性的性別煩躁患者當中，沒有發(fā)現(xiàn)性激素顯著性異常，在基因正常的女性性別煩躁患者中，發(fā)現(xiàn)了性激素中雄激素的水平存在著顯著的上升，但是上代多毛癥的女性雄激素的范圍之內(nèi)而且低于正常男性的雄性激素水平。
